Mł. insp. Rafał Batkowski w Policji służy od 1993 roku. W latach 1993 - 2001 realizował zadania służbowe w Oddziale Prewencji, Komisariacie Policji Warszawa-Okęcie i Samodzielnym Pododdziale Antyterrorystycznym. Od 2001 pracował w Komendzie Głównej Policji, w pionie prewencji, m.in.: na stanowisku naczelnika Wydziału ds. Prewencyjnych Biura Taktyki Zwalczania Przestępczości KGP oraz naczelnika Zarządu Operacji Antyterrorystycznych w Głównym Sztabie Policji KGP. Współtworzył, a od 1 lutego 2006 do 31 stycznia 2007 pełnił obowiązki zastępcy dyrektora Biura Prewencji i Ruchu Drogowego KGP. W KWP zs. w Radomiu na stanowisku zastępcy mazowieckiego komendanta służy od 2007 roku. Po tym jak na emeryturę odszedł Ryszard Szkotnicki, Komendant Główny Policji powierzył mu pełnienie obowiązków na stanowisku Mazowieckiego Komendanta Wojewódzkiego Policji.
Komendant Batkowski jest absolwentem Instytutu Profilaktyki Społecznej i Resocjalizacji Uniwersytetu Warszawskiego oraz podyplomowych studiów na Wydziale Prawa i Administracji UW, w zakresie problematyki przestępczości zorganizowanej i terroryzmu.